Aya Dong Hospital, ve spolupráci se společností Microsoft Taiwan a ATGENOMIX, úspěšně zrealizoval cloudový systém pro hlavní sekvenování genomu. Tento systém, postavený na platformě Microsoft Azure v Taiwan, přispívá k vytvoření „Trvalé platformy pro přesnou medicínu Aya Dong“ a urychluje postupy v oblasti přesné medicíny a klinického výzkumu. Stal se tak prvním prvním úrovňovým lékařským centrem na Tchaj-wanu, které implementovalo cloudový systém pro sekvenování genomu.
Generální ředitel společnosti Microsoft Taiwan, pan Bian Zhi-Hsiang, uvedl, že Aya Dong Hospital přetváří své analýzy dat pro sekvenování genomu v rámci cloudového systému Azure v Taiwan. Tímto krokem nejen otevírá možnost pro první úroveň lékařské péče v cloudu, ale zároveň se jedná o první případ v Asii, kdy je pro analýzu sekvenování genů zaměřených na rakovinu a vzácné genetické onemocnění využíván cloudový systém Azure. Pomocí cloudové architektury je možno získat okamžité přehledy z rozsáhlých dat o sekvenování genomu díky nízké latenci a flexibilnímu rozšiřování výpočetních kapacit.
Společnost Microsoft zdůrazňuje, že systém využívající Azure v Taiwan, s automatizovanými mechanismy a flexibilními výpočetními kapacitami, urychluje analýzu dat o sekvenování genomu. Tento systém pomáhá zdravotnickému personálu v postupném zlepšování identifikace a správě zdraví populace s vysokým rizikem genetických mutací. Cílem je poskytnout klinické reference v různých fázích od zdraví po onemocnění, což podporuje včasnými intervencemi s cílem snížit riziko onemocnění.
Aby Aya Dong Hospital zvýšila efektivitu analýz a flexibilitu aplikací, spolupracuje s ATGENOMIX a využívá jejich cloudovou platformu Bio-IT služby Atgenomix Seqslab, na základě níž byl vytvořen vlastní cloudový systém pro sekvenování genomu. Tento systém, provozovaný na Microsoft Azure, s kombinací flexibilních výpočetních kapacit a automatizovaných procesů, dokáže rychle zpracovat velké objemy genetických dat, což urychluje proces personalizované přesné medicíny a klinického výzkumu.
Pro shromažďování a analýzu genetických dat byla v Aya Dong Hospital zřízena a neustále aktualizována genetická datová jezera. Každé čtvrtletí nebo každých šest měsíců se do systému nahrává na sto sekvenčních dat od vyšetřovaných osob, které jsou bezpečně ukládány v Azure Data Lake. Každý účastník obsahuje přibližně 700 tisíc bodů genetických variant, což představuje značné množství dat a slouží jako důležitý základ pro další analýzy nebo výzkum.
Aby reagoval na rostoucí objemy dat a zvýšil analytickou efektivitu, systém integruje také software pro analýzu genomu s GPU akcelerací NVIDIA Parabricks, což zefektivňuje zpracování a výrazně zkracuje čas analýzy. Čas potřebný k dokončení analýzy byl snížen z původních čtyř hodin na pouhých deset minut. Pro analýzu celogenomového typování (WGG) velkého rozsahu, například pro 2500 zúčastněných osob, je čas dokončení nyní 40 hodin, což představuje šestnáctinásobné zvýšení efektivity.
Generální ředitel ATGENOMIX, Zhang Ming-Tai, potvrdil, že cloudová platforma Microsoft Azure dokáže splnit nároky na velké a rychlé výpočetní a úložné potřeby, čímž přispívá k praktickému zavedení přesné medicíny v klinické praxi.
